Было написано же, что нужно удалить старую базу блоков и пересинхронизироваться...

Клиент 0.4.4.6 не совместим с файлами БД блокчейна, создаваемыми более ранними версиями. Перед запуском нового клиента нужно стереть из каталога данных приложения все, кроме wallet.dat (можно еще оставить peers.dat и novacoin.conf если есть).
Note that this commit makes blockindex code incompatible with old blockchain database files. You need to remove old blockchain files and syncronize with the network again.
Novacoin 0.4.4.6 statically linked Windows 64 bit binaries, compiled with MINWG-w64 4.6.3
Note that this release introduces an incompatible changes into the format of block index database. You have to
remove everything except wallet.dat and configuration file from your data directory, otherwise you will get
assertion error at startup.
Data directory is located at
Windows Vista/7/8/2008 Server - C:\Users\<UserName>\AppData\Roaming\NovaCoin
Windows 200/XP - C:\Documents and Settings\<UserName>\Application Data\NovaCoin
P.S. It's recommended to perform wallet.dat back up periodically.
NovaCoin 0.4.4.6 - experimental decentralized cryptocurrency
Note that this update includes a blockindex code which is incompatible with old blockchain database files. You need to remove old blockchain files and syncronize with the network again.
P.S. Может, кому будет полезно - форматы БД у 64 и 32-разрядных версий полностью идентичны. Так что обе версии могут использовать один и тот же каталог данных по очереди, если есть желание.